Alfrēda Kalniņa Cēsu Mūzikas vidusskola realizē profesionālās ievirzes izglītības programmas, profesionālās vidējās izglītības programmas, kā arī profesionālās ievirzes vidējās izglītības programmas. Skola īsteno šādas izglītības programmas:
Izglītības programma “Taustiņinstrumentu spēle” (klavieres, akordeons)
Programmas vadītāja Ilze Mazkalne
Izglītības programma “Stīgu instrumentu spēle” (vijole, čells, alts, kokle, ģitāra)
Programmas vadītāja Inese Nelsone
Izglītības programma “Pūšaminstrumentu spēle” (flauta, fagots, klarnete, mežrags, saksofons, trompete, eifonijs, trombons, tuba)
Programmas vadītāja Elita Ezermale
Izglītības programma “Sitaminstrumentu spēle”
Programmas vadītājs Raitis Viļumovs
Izglītības programma “Vokālā mūzika”
Programmas vadītāja Dace Balode
Izglītības programma “Diriģēšana”
Programmas vadītājs Patriks Kārlis Stepe
Izglītības programma “Mūzika” (Populārā un džeza mūzika)
Programmas vadītāja Ināra Rubīna